Ustawa z 4.10.2016 r. o zmianie ustawy o transporcie drogowym (Dz.U. z 2016 r., poz. 1935; dalej: Nowelizacja) wprowadza w tym zakresie istotną zmianę. Otóż dobrą reputację należy potwierdzić zaświadczeniem z Krajowego Rejestru Karnego. Na pozytywne nie mogą liczyć osoby, które otrzymały prawomocny wyrok skazujący za przestępstwa umyślne z zakresu prawa handlowego, upadłościowego czy o ruchu drogowym. Dobrą reputację traci się również, gdy zarządzający transportem lub przedsiębiorca został skazany w którymś z państw UE za poważne przestępstwo.
Przy dokonywaniu oceny dobrej reputacji brana będzie pod uwagę nie tylko liczba stwierdzonych naruszeń. Trzeba będzie ją zestawić z liczbą kierowców u danego przedsiębiorcy. Po wydaniu decyzji stwierdzającej utratę dobrej reputacji przez przedsiębiorcę organ zawiesi zezwolenie na wykonywanie zawodu przewoźnika drogowego na minimum rok. Jeżeli dobrą reputację utraci zarządzający transportem, będzie to równoznaczne z utratą certyfikatu kompetencji zawodowych na minimum rok.