Najważniejsza zmiana proponowana przez Ministerstwo Finansów ma polegać na wprowadzeniu nowej kategorii wniosku o interpretację przepisów prawa podatkowego – wniosku grupowego. Miałby on zastosowanie w sytuacji, gdy stan faktyczny lub zdarzenie przyszłe przedstawione we wniosku o interpretację indywidualną obejmowałby transakcje lub inne czynności dokonywane z udziałem podmiotów powiązanych, tj. podmiotem krajowym, podmiotem zagranicznym lub podmiotem, który ma stać się podmiotem krajowym lub zagranicznym. Wniosek grupowy będzie musiał m.in. wskazywać główne korzyści (w tym również podatkowe), opis występujących pomiędzy podmiotami powiązanymi powiązań, czy też wskazanie transakcji lub innych czynności dokonanych, będących w trakcie lub planowanych, od których bezpośrednio lub choćby pośrednio uzależnione jest osiągnięcie głównych korzyści. Jednocześnie wnioskodawcy mieliby zostać zobowiązani do wskazania wartości przedsiębiorstwa, jego zorganizowanej części lub prawa majątkowego objętych stanem faktycznym lub zdarzeniem przyszłym, których wartość rynkowa lub nominalna na dzień złożenia wniosku grupowego wynosi co najmniej 10 000 000 zł.
Nowelizacja ma również doprowadzić do zmiany brzmienia art. 14s ustawy z 29.8.1997 r. Ordynacja podatkowa (t.j. Dz.U. z 2017 r. poz. 201 ze zm.), w taki sposób, by stworzona została możliwość występowania z wnioskiem o interpretację indywidualną przez podmioty udzielające dofinansowań, gdy interpretacja przepisów prawa podatkowego w indywidualnej sprawie otrzymującego dofinansowanie ma wpływ na jego wysokość. Dzięki temu możliwe byłoby jednolite traktowanie na gruncie podatkowym podmiotów uczestniczących w danym programie. Ponadto ochroną zostałyby objęte wszystkie podmioty uczestniczące w danym programie, które zastosują się do interpretacji wydanej dla podmiotu udzielającego dofinansowania.
