Państwa członkowskie UE są zobowiązane ustanowić sankcje za naruszenia przez użytkowników takich obowiązków jak:
1) gromadzenie,
2) przechowywanie,
3) okazywanie organom kontrolnym,
4) przekazywanie kolejnemu użytkownikowi stosownej dokumentacji oraz
5) składanie oświadczeń o dołożeniu należytej staranności dla zapewnienia, że zasoby genetyczne oraz związana z nimi tradycyjna wiedza, zostały pozyskane zgodnie z prawem kraju dawcy zasobów, a także poddawane są wymogom kontroli oraz zastosować wszystkie konieczne środki, by zapewnić ich wykonanie.
Ustawa wprowadza proporcjonalne i odstraszające sankcje w postaci administracyjnych kar pieniężnych stosowanych w przypadku naruszenia przepisów . Odstąpienie od wymierzenia kary pieniężnej i umorzenie postępowania jest możliwe w przypadku, gdy wykazane zostanie, że do naruszenia doszło wskutek zdarzeń lub okoliczności, którym podmiot popełniający naruszenie nie mógł zapobiec. Organem właściwym do wymierzania kar pieniężnych, w drodze decyzji administracyjnej, jest właściwy wojewódzki inspektor ochrony środowiska.
Zasoby genetyczne oznaczają cały materiał genetyczny mający faktyczną lub potencjalną wartość, pochodzący ze:
a) środowiska naturalnego,
b) utworzonych przez człowieka ogrodów botanicznych,
c) ogrodów zoologicznych,
d) banków genów,
e) mikrobiologicznych kolekcji kultur.
Kolekcje to zgromadzony i przechowywany zestaw próbek i związanych z nimi informacji. Są one głównymi, wyspecjalizowanymi dostawcami wykorzystywanych w UE zasobów genetycznych. Kolekcje tworzone są w celu dostarczania naukowcom lub hodowcom materiału do badań lub prac naukowych, a ponadto stanowią rezerwę materiału genetycznego w razie jego utraty.